Böyük ölçülü çoxmərkəzli təsdiqlə beyincik MRI‑dən avtomatlaşdırılmış servikal onurğa kord vertebra etiketlənməsi və morfometrik çıxarılması üçün dərin öyrənmə çərçivəsi.

Bu tədqiqat T1 çəkilmiş beyin MRI-də üst cervikal sırt dənəsi (SC) -nin omurğa səviyyəsini müəyyənləşdirmək üçün tam avtomatlaşdırılmış bir boru kəməri hazırlamaq və təsdiqləmək məqsədi daşıyır. 998 nəzarətdən və 879 irsi ataxiya olan xəstələrdən alınan MRI məlumatları (32 yer; 585 il yaş; 46% kişi) dərin öyrənmə modellərinin (nnU- Net, SwinUNETR, dərin nəzarətlə U- Net) C1C3 səviyyələrinin avtomatik vertebral etiketlənməsi üçün təlim edilməsi üçün istifadə edildi. VGG, ResNet və EfficientNet memarlıqlarına əsaslanan ikincil model omurğa etiketləmə səhvlərini müəyyənləşdirmək üçün təlim olundu. Bu boru kəmərində həmçinin signal-ağza nisbəti, kontrast-ağza nisbəti, birgə dəyişiklik koeffitsienti və entropiya fokus kriteriyası daxil olmaqla görüntü keyfiyyətinin ölçüləri istehsal olunur. 4 ictimai məlumat dəstindən 2737 MRİ istifadə edərək xarici təsdiqləmə aparılmış və klinik faydalılıq 51 çoxlu sklerozlu xəstəliyin uzunluq kohortasında sübut edilmişdir. nnU-Net ən yüksək performans əldə etdi (Dice: C1 = 0,85, C2 = 0,89, C3 = 0,89), Spinal Cord Toolbox-dan yanlış etiketlənmiş halların 95,8% -ni etiketlədi. VGG əsaslı təsnifatçı 97,9% dəqiqlik və 98,7% həssaslıq əldə etdi. Xarici təsdiqləmə beş məlumat dəstindən dördündə etiketləmə dəqiqliyi 92% -dən çox və çoxlu sklerozda uzunluq SC atrofiyasına həssaslığı göstərdi. Bu boru kəmərinin çox mərkəzli tədqiqatlar üçün yuxarı cervikal SC-nin miqyaslı, etibarlı vertebral etiketlənməsini və morfometrik çıxarılmasını təmin edir və neurodegenerativ xəstəliklərdə biomarkerlərin inkişafına dəstək verir.

Müəlliflər tədqiqatda iştirak etdikləri üçün bütün şəxslərə və Friedreich'in Ataxia Tədqiqat Alyansına (FARA, ABŞ) FRDA iştirakçılarının işə qəbul edilməsinə kömək etdikləri üçün minnətdarlıq bildirirlər. Müəlliflər FARA, Takeda Pharmaceuticals Company, Novartis Gene Therapies, IXICO plc, PTC Therapeutics və Larimar Therapeutics-a maliyyələşdirmədə dəstək və TRACK-FA Neuroimaging Konsorsiumunda iştirak etdikləri üçün təşəkkür və təşəkkür edirlər. Maliyyə dəstəyi üçün Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior-a təşəkkür edirik. Tədqiqat məlumatları Helix (Monash Universiteti, Avstraliya) tərəfindən aparılan və idarə olunan REDCap elektron məlumat yığma alətləri istifadə edərək toplanıb idarə edilib.9,28. Tədqiqat məlumatları Monash (MXNAT) və Monash Biomedical Imaging (MBIXNAT) (Monash Universiteti, Avstraliya) tərəfindən yerləşən neuroimaging laboratoriya məlumatlarının idarə edilməsi üçün proqram çərçivəsi olan XNAT istifadə edərək toplanıb, saxlanılıb və idarə edilib. Müəlliflər bütün TRACK-FA və READISCA saytlarının tədqiqat koordinatorlarına iştirakçıların işə qəbul edilməsində və test edilməsində göstərdikləri yardım üçün təşəkkür edirlər. Aşağıdakı əməkdaşlar adlarının tanınmasını seçdilər: Pedro Marcelino Mendes Novaes Melo, Campinas, Braziliya, Campinas Universitetinin Neyrologiya Departamentindən; Jennifer Farmer, Friedreichs Ataxia Research Alliance (FARA), Downingtown, Pensilvaniya, ABŞ; Tobias Linding, Diagnostika və İntervensiya Neyroradiologiya Departamentindən, Tübingen, Tübingen, Almaniya Universitet Xəstəxanasından; Thomas H. Mareci, Florida Universitetinin Biokimya və Molekulyar Biologiya kafedrası, Florida, ABŞ; Henry Paulsen, Miçiqan Universitetinin Neyrologiya kafedrası, Ann Arbor, MI, ABŞ. Jörg B. Schulz, Neyrologiya kafedrası, RWTH Aachen Universiteti, Aachen, Almaniya. JARA-BRAIN İnstitutunun Molekulyar Neyrologiya və Neyromanq, Jülich GmbH, Almaniyanın Tədqiqat Mərkəzi; Caterina Tonon, İtaliyanın Boloniya Universitetinin Biomedik və Neyromotor Elmlər Bölməsi. İrccs Bologna Neyroloji Elmlər İnstitutu, Funksional və Molekulyar Neyromanq Birliyi, Bologna, İtaliya.

Bu iş Friedreichs Ataxia Tədqiqat Alyansı (FARA Ümumi Tədqiqat Qrantı), São Paulo Tədqiqat Fondu (FAPESP, qrant # 25/00186-4), Braziliya Federal Tələbə Təhsilinin Dəstək və Qiymətləndirilməsi Agentliyi (CAPES) və Avstraliya Milli Səhiyyə və Tibb Tədqiqat Şurasının (NHMRC Ideas Grant 1184403) qrantları tərəfindən dəstəklənmişdir. Bu araşdırmanın nəşrinə bağlı məqalələrin işlənməsi haqqı Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) tərəfindən dəstəklənmişdir (AUXPE Proces 88881.859210/2023-01). Maliyyə agentlikləri tədqiqatın dizaynına, məlumat toplanmasına və ya əlyazmanın hazırlanmasına təsir etmədilər.

Bu müəlliflər də eyni dərəcədə töhfə verirdilər: Gustavo M. Jarola, Diogo H. Şiraşi.

Bu müəlliflər bu işə birgə nəzarət edirdi: Ian H. Harding, Tiyago J. R. Rezende.

Neyrologiya kafedrası, Tibb Elmləri Fakültəsi, Campinas Universitetində (Unicamp), Campinas, Braziliya