Bu məqalə Science X-in redaksiya prosesinə və siyasətlərinə uyğun olaraq nəzərdən keçirilib. Redaktorlar məzmunun etibarlılığını təmin edərkən aşağıdakı atributları vurğuladılar: Bədəndəki hər bir hüceyrə mahiyyətcə eyni DNT-ni ehtiva edir, lakin beyin hüceyrəsi əzələ hüceyrəsi və ya immun hüceyrədən fərqli davranır. Fərq böyük ölçüdə hər bir hüceyrənin öz genetik təlimatlarını necə oxuduğundadır.
Transkripsiya faktorları adlanan zülallar xüsusi DNT ardıcıllığını bağlayır və genlərin nə vaxt və harada aktiv olduğunu idarə etməyə kömək edir. Onlar embrion inkişafdan immunitet funksiyasına qədər olan prosesləri istiqamətləndirirlər. Bu tənzimləmə səhv olarsa, xəstəlik yarana bilər.
İnsan genomunda 1600-ə yaxın transkripsiya faktoru olsa da, bir çoxunun DNT-yə bağlanma üstünlükləri naməlum olaraq qalır. Toronto Universitetində Timothy Hughes-in rəhbərlik etdiyi beynəlxalq əməkdaşlıq Nature jurnalında dərc olunan bir araşdırmada bu boşluqların çoxunu doldurdu. Tədqiqatçılar beş eksperimental platformanı hesablama analizləri ilə birləşdirib, 4800-dən çox təcrübə həyata keçirib və əvvəllər zəif xarakterizə edilən 177 transkripsiya faktoru üçün DNT-ni bağlayan motivləri müəyyən ediblər.
Əsər insan genlərinin tənzimlənməsinin məlum lüğətinə 130-a yaxın fərqli motiv əlavə etdi. İş "Kod kitabçası" yaratdı: bu günə qədər yığılmış insan transkripsiya faktorunu birləşdirən üstünlüklərin ən əhatəli kataloqu. Bart Deplancke-nin EPFL-dəki laboratoriyası Codebook-un hazırlanmasında mərkəzi rol oynamışdır.
"Bizim genomlarımız həyat üçün təlimatları ehtiva edir, lakin hüceyrələrin əslində bu təlimatları necə oxuduğunu anlamaq biologiyanın əsas problemlərindən biri olaraq qalır" dedi Təbiət tədqiqatının həmmüəllifi olan professor. "Bu iş bizi gen ifadəsini idarə edən zülalların tam lüğətinə daha da yaxınlaşdırır." Ancaq DNT oxumaq hekayənin yalnız bir hissəsidir. DNT həmçinin, ardıcıllığın özünü dəyişdirmədən genlərin necə tənzimlənməsinə təsir edən kimyəvi modifikasiyaları da daşıyır.
Ən məşhurlarından biri DNT metilasiyasıdır. Nature Communications-da nəşr olunan bir məqalədə Deplancke komandası eyni təcrübədə transkripsiya faktorunu metilləşdirilmiş və metilləşməmiş DNT ilə bağlayan mikrofluidik üsul olan meSMiLE-seq-ni inkişaf etdirdi. Tədqiqatçılar 114 transkripsiya faktorunu öyrənmək üçün metoddan istifadə etdilər və 48 üçün DNT-ni bağlayan modellər əldə etdilər.
Xülasə — davamını mənbədə oxuyun.
